Madre de Dios en el departamento con abundante selva virgen, probablemente el área más prístino de la amazonia peruana, la región alberga a tribus nativas quienes aun siguen sus formas tradicionales de vida, los grupos principales son los Huarayos, Mashcos, Piros, Amahuacas, Yamanahuas, Amaracaes y Machiguengas.
Cuenta con innumerables microclimas y variedad de suelos que facilita el desarrollo de una gran biodiversidad y formas de vida. Madre de Dios posee algunos de los mejores suelos de toda la Selva Amazónica, históricamente la recolección de caucho y la nuez de Brasil era permitida (desafortunadamente el caucho ha sido aprovechado por la reciente legislación y la unión Europea, dejando a los colectores de nueces sin del trabajo). Otras fuentes de ingresos también dependen de la riqueza natural de la región; tala de arboles, dragado de oro, eco-turismo y la construcción de Barcos. Las tierras de los pasivos ríos y sus hermosas lagunas dan origen a la exuberante vegetación a lo largo de sus bordes.
La cuenca amazónica tropical en donde Puerto Maldonado esta ubicado es un área cálida y húmeda casi todo el año. La temperatura anual promedio varia entre 27ºC-45ºC, y con una precipitación anual superior a los 1.0058m. Durante Octubre-Abril es la temporada de lluvias es cuando las inundaciones son muy frecuentes y algunas pistas o carretas pueden ser afectadas, pero raramente esta temporada afecta a la misma ciudad, por que esta ubicada en una zona elevada. A veces, vientos polares del sur andino soplan y causan el fenómeno que los locales bautizaron como el Surazo o el friaje las cuales hacen que las temperaturas desciendan hasta los 7ºC por varios días.
Como parte del comité de exploración de la selva, designada por el gobierno peruano en 1901, Don Juan Villalta lidero la expedición a lo largo del rio Tambopata, fundando así Puerto Maldonado en 1902. Cuando el departamento de Madre de Dios fue creado diez años después, Puerto Maldonado fue designada como su capital, sin embargo no llego a ser una ciudad reconocida hasta 1985. Fitzcarrald es continuamente asociado con la fundación de Puerto Maldonado, pero en realidad el exploro Madre de Dios en 1961 y murió ahogado en las aguas del rio Mamoré, sin embargo él fue quien exploro el área en la búsqueda implacable de oro, basado el los rumores de los Ashaninkas locales y las tribus de los Machiguengas, finalmente encontró la zona donde los ríos se unían (donde actualmente puerto Maldonado se ubica) y abrió el área de extracción de caucho.
El remoto asentamiento, que solo atrajo a buscadores de oro, recolectores de caucho, leñadores y cazadores, Puerto Maldonado se ha ido modernizando al pasar de los años y en la actualidad cuenta con una población de 30,000 habitantes. La avenida principal de León Valverde la cual cuenta con bares, restaurantes donde sus visitantes pueden degustar las bebidas mas exóticas y escuchar la siempre popular música chica. Las industrias importantes son; las nueces del Brasil, el oro y la madera así como la agricultura y la ganadería que se extiende a lo largo de las carreteras y principales ríos, el ecoturismo y la conservación son industrias relacionadas y muy relevantes en la zona.